Российское общество патологоанатомов (РОП) было создано в 1923 году, когда в Петрограде состоялся I Съезд РОП. Председателем РОП был избран ведущий отечественный патологоанатом Алексей Иванович Абрикосов. В состав правления общества вошли известные российские патологоанатомы: Ипполит Васильевич Давыдовский, Николай Николаевич Аничков, Николай Федотович Мельников-Разведенков, Георгий Владимирович Шор. Иностранными членами правления были избраны видные немецкие ученые K.Aschof и O.Lubarsch. В 1925 году в Москве под председательством А.И. Абрикосова состоялся II Всероссийский съезд патологов. В состав правления дополнительно вошли Владимир Тимофеевич Талалаев и Фёдор Яковлевич Чистович. РОП функционировало до Великой Отечественной войны. После создания в 1947 году Всесоюзного общества патологоанатомов РОП перестало самостоятельно функционировать и влилось в состав Всесоюзного общества.
В связи с событиями, приведшими к распаду СССР, Всесоюзное общество патологоанатомов прекратило свою деятельность, и в декабре 1990 года в г. Обнинске состоялась Учредительная конференция по организации Всероссийского общества патологоанатомов. Председателем правления общества был избран профессор Юрий Ливерьевич Перов. В 1994 году Всероссийское общество патологоанатомов преобразовалось в Ассоциацию патологоанатомов, сделавшую попытку воссоздать функции Всесоюзного общества патологоанатомов и объединить патологоанатомов стран СНГ. Во главе Ассоциации стоял Ю.Л. Перов. Однако, тяжелые социально-экономические условия 90-х годов не дали возможности реализовать деятельность Ассоциации. С 1995 по 2004 год вновь возродилось РОП, которое возглавил член-корреспондент РАМН, профессор Олег Константинович Хмельницкий.
После смерти О.К. Хмельницкого в 2004 году РОП было впервые юридически оформлено и зарегистрировано в Минюсте Российской Федерации как профессиональное общественное объединение. В Москве состоялся Учредительный съезд РОП, избравший президентом член-корреспондента РАН Льва Владимировича Кактурского, который бессменно возглавлял общество на протяжении 18 лет. За эти годы было проведено 5 съезда и 12 Пленумов РОП в разных городах России, проведено много конференций, симпозиумов, школ и др. мероприятий. Был создан сайт РОП. Под эгидой РОП издан ряд периодических изданий, руководств, книг.
По инициативе РОП создана система контроля качества патологоанатомической службы – Система добровольной сертификации патологоанатомических исследований, выходящая на международный уровень с внедрением критериев оценки качества системы NordiQS. В 2022 году на VI Съезде Российского общества патологоанатомов Президентом РОП избран доктор медицинских наук, заслуженный врач РФ, Главный специалист по патологической анатомии ФМБА России Забозлаев Федор Георгиевич. В настоящее время РОП объединяет региональные отделения в 50 субъектах Российской Федерации.